DEVI, LASTRI (2021) MULTIPLE SEQUENCE ALIGNMENT PADA RANTAI DNA DENGAN ALGORITMA GENETIKA. S1 thesis, Universitas Mataram.
![[img]](http://eprints.unram.ac.id/style/images/fileicons/text.png) |
Text
Devi Lastri - Skripsi Acc.pdf Restricted to Repository staff only Download (4MB) |
Abstract
Penjajaran sekuens dari tiga atau lebih sekuens biologis seperti DNA dikenal sebagai multiple sequence alignment. Multiple sequence alignment adalah salah satu operasi paling mendasar dalam analisis sequence biologis. Penjajaran sekuens akan membutuhkan waktu yang relatif lama untuk sekuens yang lebih panjang, oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaplikasian metode heuristik seperti algoritma genetika dalam menyelesaikan permasalahan multiple sequence alignment. Algoritma genetika adalah jenis algoritma iteratif yang memungkinkan pencarian yang efisien dan kuat. Dalam proses algoritma genetika dimulai dengan inisialisasi keadaan awal (populasi), multiple sequence alignment dapat diimplementasikan sebagai matriks n baris dan setiap baris berisi satu sekuens. Dalam penelitian ini digunakan operator algoritma genetika sederhana berupa one-point crossover dan mutasi sederhana dengan melakukan open gap dan reduce gap. Untuk metode seleksi dalam penelitian ini menggunakan metode rank selection. Untuk melihat pengaplikasian algoritma genetika dalam menyelesaikan permasalahan multiple sequence alignment pada penelitian ini dilakukan simulasi terhadap spesies Eugenia salamensis, Eugenia capensis, Eugenia nesiotica, dan Psidium guajava. Hasil penelitian menunjukkan bahwa algoritma genetika mampu menemukan solusi permasalahan multiple sequence alignment.
| Item Type: | Thesis (S1) |
|---|---|
| Keywords (Kata Kunci): | Kata kunci: Algoritma genetika, multiple sequence alignment, operator crossover, operator mutasi, rank selection, DNA |
| Subjects: | Q Science > Q Science (General) |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan ilmu Pengetahuan Alam |
| Depositing User: | Rini Trisnawati |
| Date Deposited: | 03 Mar 2021 07:04 |
| Last Modified: | 03 Mar 2021 07:04 |
| URI: | http://eprints.unram.ac.id/id/eprint/21245 |
Actions (login required)
 |
View Item |
