Optimasi Ekstraksi Dna Dari Spesimen Feses Pasien Kanker Kolorektal

Wardoyo, Eustachius Hagni and Sabrina, Yunita and Suryani, Dewi and Indriawan, Ramses (2020) Optimasi Ekstraksi Dna Dari Spesimen Feses Pasien Kanker Kolorektal. The Indonesian Journal of Infectious Diseases, 6 (1). pp. 41-50. ISSN 2354-6077

Preview

Text LampB12 2020_09_03 Publikasi penelitian Optimasi ekstraksi DNA pasien kanker kolorektal2020.pdf Download (634kB) | Preview

Abstract

Latar Belakang: Pasien kanker kolorektal sering mengalami diare, baik itu karena konsekuensi langsung akibat penyakit, efek samping kemoterapi/radioterapi, atau karena adanya infeksi. Perubahan konsistensi feses pasien kolorektal dalam kemoterapi menyebabkan perubahan komposisi feses (jumlah sel bakteri, komposisi inhibitor) yang berbeda pada feses manusia normal. Konsekuensinya ekstraksi DNA bacterial dari feses pasien kanker kolorektal dalam kemoterapi perlu dilakukan optimasi. Tujuan penelitian untuk mendapatkan protokol DNA optimal dari feses cair pasien kolorektal. Metode: Ekstraksi DNA menggunakan Quick-DNA™ Fecal/Soil Microbe Miniprep Kit (Zymoresearch). Terdapat 3 pilihan protocol yang dilakukan, yang mana 2 protokol lainnya yang merupakan modifikasi dari protokol standar yang mengikuti prinsip: 1. Disrupsi mekanis untuk memisahkan sel bakteri dari materi feses dengan modifikasi lama sentrifugasi, 2. Proses binding DNA dengan modifikasi kecepatan sentrifugasi, 3. Proses mendapatkan DNA elusi dengan modifikasi gradien volume buffer DNA. Protokol standar diaplikasikan pada feses kontrol berpasangan usia dan jenis kelamin dan feses sampel, sedang 2 protokol lainnya diaplikasikan hanya pada feses sampel. Rasio absorbansi A260/280 ≥ 1.8 menggunakan Nanodrop™ di aplikasikan pada konsentrasi DNA yang dinyatakan sebagai DNA murni. Pemeriksaan dilakukan sebanyak 3 kali dan reratanya dilaporkan dalam penelitian ini. Hasil: Rasio absorbansi sebesar A260/280 ≥1.8 didapatkan pada protocol ketiga yakni dengan rerata rasio absorbansi A260/280 1.81, sedangkan pada protokol 2 dan 3 feses sampel menunjukkan rerata rasio absorbansi A260/280 1.79 dan 1.81.Kesimpulan: Protokol ketiga dalam penelitian ini merupakan protokol optimal untuk ekstraksi DNA pada sampel feses pasien pasien kanker kolorektal paska kemoterapi.

Item Type:	Article
Keywords (Kata Kunci):	ekstraksi DNA, feses diare, kanker kolorektal
Subjects:	R Medicine > RZ Other systems of medicine
Divisions:	Fakultas Kedokteran
Depositing User:	Dr Eustachius Hagni Wardoyo
Date Deposited:	16 Apr 2023 07:12
Last Modified:	16 Apr 2023 07:12
URI:	http://eprints.unram.ac.id/id/eprint/36592

Actions (login required)

View Item